Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP2B1P20020 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms