Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM225BP0DP42 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms