Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGAP02671 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGAP02671 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGAP02671 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGAP02671 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGAP02671 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FGAP02671 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms