Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNC1O60486 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNC1O60486 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms