Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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