Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPF3O43395 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms