Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC1BO15143 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms