Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf229H3BNL8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms