Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms