Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DSR2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DSR2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DSR2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DSR2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DSR2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DSR2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DSR2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DSR2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DSR2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DSR2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DSR2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms