Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSDA5PKW4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms