Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms