Protein–RNA interactions for Protein: S4R2P9

Slc8a3, Sodium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a3S4R2P9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc8a3S4R2P9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc8a3S4R2P9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc8a3S4R2P9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc8a3S4R2P9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8a3S4R2P9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms