Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd3Q9JJY3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd3Q9JJY3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd3Q9JJY3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpd3Q9JJY3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smpd3Q9JJY3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms