Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacna1fQ9JIS7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1fQ9JIS7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cacna1fQ9JIS7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cacna1fQ9JIS7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1fQ9JIS7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms