Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D727 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D727 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D727 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D727 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D727 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D727 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D727 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D727 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D727 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D727 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D727 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D727 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D727 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D727 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D727 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D727 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D727 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D727 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D727 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D727 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D727 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D727 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D727 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D727 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D727 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D727 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D727 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D727 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D727 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D727 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D727 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D727 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D727 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D727 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D727 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D727 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D727 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D727 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D727 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D727 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D727 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D727 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D727 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D727 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D727 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D727 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D727 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D727 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D727 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D727 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D727 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D727 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D727 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D727 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D727 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D727 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D727 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D727 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D727 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D727 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D727 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D727 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D727 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D727 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D727 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D727 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D727 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D727 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.6 ms