Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab29Q91YQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab29Q91YQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab29Q91YQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab29Q91YQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.9 ms