Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC85

Lsm1, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm1Q8VC85 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsm1Q8VC85 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm1Q8VC85 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm1Q8VC85 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm1Q8VC85 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm1Q8VC85 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms