Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BbxQ8VBW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BbxQ8VBW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BbxQ8VBW5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BbxQ8VBW5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BbxQ8VBW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms