Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHF7

Pgs1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgs1Q8BHF7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgs1Q8BHF7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pgs1Q8BHF7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgs1Q8BHF7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pgs1Q8BHF7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgs1Q8BHF7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pgs1Q8BHF7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms