Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Htatsf1Q8BGC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Htatsf1Q8BGC0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Htatsf1Q8BGC0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Htatsf1Q8BGC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms