Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ssh1Q76I79 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssh1Q76I79 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ssh1Q76I79 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ssh1Q76I79 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms