Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chsy1Q6ZQ11 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chsy1Q6ZQ11 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chsy1Q6ZQ11 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chsy1Q6ZQ11 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Chsy1Q6ZQ11 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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