Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HnrnpdQ60668 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HnrnpdQ60668 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HnrnpdQ60668 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HnrnpdQ60668 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms