Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf123Q5XPI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf123Q5XPI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rnf123Q5XPI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf123Q5XPI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf123Q5XPI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rnf123Q5XPI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms