Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10488Q4KL05 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10488Q4KL05 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10488Q4KL05 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10488Q4KL05 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10488Q4KL05 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm10488Q4KL05 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10488Q4KL05 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm10488Q4KL05 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm10488Q4KL05 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm10488Q4KL05 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms