Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc38a11Q3USY0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc38a11Q3USY0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc38a11Q3USY0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms