Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
InipQ3TXT3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
InipQ3TXT3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
InipQ3TXT3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
InipQ3TXT3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms