Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cul4aQ3TCH7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cul4aQ3TCH7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cul4aQ3TCH7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cul4aQ3TCH7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cul4aQ3TCH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
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