Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 GUT1YHL032C 2130 nt8.15□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 YGR137WYGR137W 375 nt8.14□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 TRR2YHR106W 1029 nt8.14□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 PRS4YBL068W 981 nt8.14□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 HIS3YOR202W 663 nt8.14□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 MBF1YOR298C-A 456 nt8.14□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 PRC1YMR297W 1599 nt8.14□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 CDC3YLR314C 1563 nt8.13□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 WSC3YOL105C 1671 nt8.12□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 RRP43YCR035C 1185 nt8.12□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 TOP3YLR234W 1971 nt8.11□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 CPR2YHR057C 618 nt8.11□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 HRB1YNL004W 1365 nt8.1□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 YER152CYER152C 1332 nt8.1□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 PMA2YPL036W 2844 nt8.09□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 GAL83YER027C 1254 nt8.09□□□□□ -1.11
RTP1Q12751 ECM10YEL030W 1935 nt8.08□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 PSA1YDL055C 1086 nt8.08□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 ARO3YDR035W 1113 nt8.08□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 STE3YKL178C 1413 nt8.08□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 BEM1YBR200W 1656 nt8.08□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.07□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 MNN9YPL050C 1188 nt8.07□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 SGV1YPR161C 1974 nt8.07□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 DIP5YPL265W 1827 nt8.07□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 BUD31YCR063W 474 nt8.06□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 YMR074CYMR074C 438 nt8.06□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 OSM1YJR051W 1506 nt8.06□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 NDE2YDL085W 1638 nt8.06□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 MPH3YJR160C 1809 nt8.06□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 PMP3YDR276C 168 nt8.05□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 YNL295WYNL295W 1575 nt8.05□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 TIF3YPR163C 1311 nt8.04□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 BIM1YER016W 1035 nt8.04□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 TDA4YJR116W 840 nt8.04□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 INP54YOL065C 1155 nt8.04□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 MET13YGL125W 1803 nt8.03□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 FRT1YOR324C 1809 nt8.03□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 PRY2YKR013W 990 nt8.03□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 INO1YJL153C 1602 nt8.03□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 BIO3YNR058W 1443 nt8.03□□□□□ -1.12
RTP1Q12751 CHA1YCL064C 1083 nt8.02□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 HXT9YJL219W 1704 nt8.02□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 WSC4YHL028W 1818 nt8.01□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 PIL1YGR086C 1020 nt8.01□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 SNP1YIL061C 903 nt8□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 SPE4YLR146C 903 nt8□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 SML1YML058W 315 nt8□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 YPL264CYPL264C 1062 nt8□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 HAL5YJL165C 2568 nt8□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 ALG7YBR243C 1347 nt8□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 SPS1YDR523C 1473 nt8□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.99□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 ERG10YPL028W 1197 nt7.99□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 ATG22YCL038C 1587 nt7.99□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 MRN1YPL184C 1839 nt7.99□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 DAL7YIR031C 1665 nt7.98□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.98□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 LDB7YBL006C 543 nt7.98□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 ATP10YLR393W 840 nt7.98□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 YML122CYML122C 381 nt7.98□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 SUN4YNL066W 1263 nt7.98□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 YOR300WYOR300W 309 nt7.98□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 YPT10YBR264C 600 nt7.98□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 CYS4YGR155W 1524 nt7.98□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 SGF73YGL066W 1974 nt7.97□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 GLY1YEL046C 1164 nt7.97□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 YLR184WYLR184W 348 nt7.97□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 YNL140CYNL140C 570 nt7.97□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 DSC3YOR223W 879 nt7.97□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 DML1YMR211W 1428 nt7.96□□□□□ -1.13
RTP1Q12751 DST1YGL043W 930 nt7.96□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 ERR3YMR323W 1314 nt7.96□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 ERR1YOR393W 1314 nt7.96□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 ERR2YPL281C 1314 nt7.96□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 TGL5YOR081C 2250 nt7.95□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 GGC1YDL198C 903 nt7.95□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 MRP7YNL005C 1116 nt7.94□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 snR30snR30 606 nt7.94□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 NFS1YCL017C 1494 nt7.94□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 AFG2YLR397C 2343 nt7.94□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 YHC3YJL059W 1227 nt7.93□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 IDP3YNL009W 1263 nt7.93□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 NAF1YNL124W 1479 nt7.93□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 PPZ2YDR436W 2133 nt7.93□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 FCY22YER060W-A 1593 nt7.93□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 DCR2YLR361C 1737 nt7.92□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 GET2YER083C 858 nt7.92□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 PAM17YKR065C 594 nt7.92□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 YLR162WYLR162W 357 nt7.92□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 YPL136WYPL136W 369 nt7.92□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 PMT1YDL095W 2454 nt7.91□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 SKP1YDR328C 585 nt7.91□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 OPI7YDR360W 435 nt7.91□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 PDA1YER178W 1263 nt7.91□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 INM1YHR046C 888 nt7.91□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 YMR253CYMR253C 1245 nt7.91□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 AIM20YIL158W 615 nt7.9□□□□□ -1.14
RTP1Q12751 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.89□□□□□ -1.15
RTP1Q12751 YPQ2YDR352W 954 nt7.89□□□□□ -1.15
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