Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb8Q0VBD0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb8Q0VBD0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itgb8Q0VBD0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itgb8Q0VBD0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms