Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 GLN3YER040W 2193 nt5.91□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 YLL058WYLL058W 1728 nt5.91□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 YCR025CYCR025C 411 nt5.91□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 RTC2YBR147W 891 nt5.91□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 ARG7YMR062C 1326 nt5.91□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 YDR306CYDR306C 1437 nt5.91□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 FPR2YDR519W 408 nt5.9□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 YHR033WYHR033W 1272 nt5.9□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 YJL043WYJL043W 774 nt5.9□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 HAM1YJR069C 594 nt5.9□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 PGC1YPL206C 966 nt5.9□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 AOS1YPR180W 1044 nt5.9□□□□□ -1.46
UPS3Q04006 SHC1YER096W 1539 nt5.89□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 TKL2YBR117C 2046 nt5.89□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 YIP4YGL198W 708 nt5.89□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt5.89□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 LSP1YPL004C 1026 nt5.89□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 TIM50YPL063W 1431 nt5.89□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 NOG2YNR053C 1461 nt5.89□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 HTS1YPR033C 1641 nt5.88□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 AFG3YER017C 2286 nt5.88□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 NAP1YKR048C 1254 nt5.88□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 LOT6YLR011W 576 nt5.88□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 YMR206WYMR206W 942 nt5.88□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 NUP84YDL116W 2181 nt5.88□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 AVT4YNL101W 2142 nt5.87□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 TPI1YDR050C 747 nt5.87□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 SNF4YGL115W 969 nt5.87□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 YGR210CYGR210C 1236 nt5.87□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 HXT2YMR011W 1626 nt5.87□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 YPR084WYPR084W 1371 nt5.86□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 MSS51YLR203C 1311 nt5.86□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 SER2YGR208W 930 nt5.86□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 AIM2YAL049C 741 nt5.86□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 TCB1YOR086C 3561 nt5.86□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 GTT3YEL017W 1014 nt5.85□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 TOS1YBR162C 1368 nt5.84□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 CYC8YBR112C 2901 nt5.84□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 YDR327WYDR327W 327 nt5.84□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 QCR6YFR033C 444 nt5.84□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 CAR2YLR438W 1275 nt5.84□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 YPL108WYPL108W 507 nt5.84□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 YBR232CYBR232C 360 nt5.84□□□□□ -1.47
UPS3Q04006 YCR041WYCR041W 333 nt5.83□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 YNL200CYNL200C 741 nt5.83□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 DST1YGL043W 930 nt5.82□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 PRY2YKR013W 990 nt5.82□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 FRE5YOR384W 2085 nt5.82□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 JHD1YER051W 1479 nt5.82□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 HNM1YGL077C 1692 nt5.82□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 DAL4YIR028W 1908 nt5.82□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 FCY22YER060W-A 1593 nt5.81□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 RAD51YER095W 1203 nt5.81□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 BXI1YNL305C 894 nt5.81□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 FCY2YER056C 1602 nt5.81□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 ECM38YLR299W 1983 nt5.8□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 CPR2YHR057C 618 nt5.8□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 ERP2YAL007C 648 nt5.8□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 YLR112WYLR112W 420 nt5.8□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 YAH1YPL252C 519 nt5.8□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 TGA1tA(UGC)A 73 nt5.79□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt5.79□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt5.79□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt5.79□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt5.79□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 CTF8YHR191C 402 nt5.79□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 CEF1YMR213W 1773 nt5.79□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 GPH1YPR160W 2709 nt5.79□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 ERG24YNL280C 1317 nt5.78□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 NTG1YAL015C 1200 nt5.78□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 FCY1YPR062W 477 nt5.78□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 YPC1YBR183W 951 nt5.78□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 BDF2YDL070W 1917 nt5.78□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 YLL066CYLL066C 3618 nt5.78□□□□□ -1.48
UPS3Q04006 YEN1YER041W 2280 nt5.77□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 EFT2YDR385W 2529 nt5.77□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 EFT1YOR133W 2529 nt5.77□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 YDR215CYDR215C 414 nt5.77□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 VPS65YLR322W 315 nt5.77□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 CYB2YML054C 1776 nt5.77□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 CIR2YOR356W 1896 nt5.77□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 CDC3YLR314C 1563 nt5.76□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 RPS6AYPL090C 711 nt5.75□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 RPS6BYBR181C 711 nt5.75□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 GSH1YJL101C 2037 nt5.74□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 ARP3YJR065C 1350 nt5.74□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 POP1YNL221C 2628 nt5.74□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 DAL7YIR031C 1665 nt5.73□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 GET2YER083C 858 nt5.73□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 YER156CYER156C 1017 nt5.73□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 DAL80YKR034W 810 nt5.73□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 ERV25YML012W 636 nt5.73□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 NUP57YGR119C 1626 nt5.73□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 LAG2YOL025W 1983 nt5.73□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 KNS1YLL019C 2214 nt5.72□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 RAP1YNL216W 2484 nt5.72□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 PUS7YOR243C 2031 nt5.72□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 BRN1YBL097W 2265 nt5.72□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 YKL147CYKL147C 618 nt5.72□□□□□ -1.49
UPS3Q04006 MFT1YML062C 1179 nt5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms