Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ptprn2P80560 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ptprn2P80560 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ptprn2P80560 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ptprn2P80560 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ptprn2P80560 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms