Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctps1P70698 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctps1P70698 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctps1P70698 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctps1P70698 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ctps1P70698 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctps1P70698 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctps1P70698 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctps1P70698 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctps1P70698 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctps1P70698 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctps1P70698 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms