Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Opa1P58281 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Opa1P58281 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Opa1P58281 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Opa1P58281 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Opa1P58281 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Opa1P58281 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Opa1P58281 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Opa1P58281 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Opa1P58281 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Opa1P58281 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Opa1P58281 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Opa1P58281 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Opa1P58281 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Opa1P58281 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms