Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Samsn1P57725 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Samsn1P57725 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Samsn1P57725 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samsn1P57725 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samsn1P57725 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms