Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prim2P33610 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prim2P33610 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim2P33610 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prim2P33610 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim2P33610 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prim2P33610 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim2P33610 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prim2P33610 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prim2P33610 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prim2P33610 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prim2P33610 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim2P33610 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prim2P33610 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim2P33610 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms