Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdgfaP20033 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdgfaP20033 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdgfaP20033 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdgfaP20033 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdgfaP20033 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfaP20033 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfaP20033 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfaP20033 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfaP20033 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms