Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxb1P17919 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxb1P17919 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxb1P17919 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxb1P17919 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxb1P17919 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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