Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb2P13373 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb2P13373 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vpreb2P13373 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vpreb2P13373 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vpreb2P13373 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb2P13373 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb2P13373 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb2P13373 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vpreb2P13373 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb2P13373 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb2P13373 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vpreb2P13373 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vpreb2P13373 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vpreb2P13373 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms