Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RaraP11416 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RaraP11416 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RaraP11416 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RaraP11416 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RaraP11416 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RaraP11416 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RaraP11416 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RaraP11416 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RaraP11416 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RaraP11416 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RaraP11416 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RaraP11416 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RaraP11416 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RaraP11416 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RaraP11416 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RaraP11416 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RaraP11416 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RaraP11416 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RaraP11416 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RaraP11416 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RaraP11416 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RaraP11416 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RaraP11416 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RaraP11416 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RaraP11416 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RaraP11416 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RaraP11416 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RaraP11416 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RaraP11416 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RaraP11416 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RaraP11416 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RaraP11416 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RaraP11416 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RaraP11416 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RaraP11416 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RaraP11416 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RaraP11416 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RaraP11416 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RaraP11416 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RaraP11416 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RaraP11416 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RaraP11416 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RaraP11416 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RaraP11416 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RaraP11416 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RaraP11416 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RaraP11416 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RaraP11416 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RaraP11416 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RaraP11416 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RaraP11416 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RaraP11416 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RaraP11416 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RaraP11416 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RaraP11416 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RaraP11416 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RaraP11416 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RaraP11416 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RaraP11416 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RaraP11416 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RaraP11416 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RaraP11416 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RaraP11416 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RaraP11416 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RaraP11416 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RaraP11416 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RaraP11416 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RaraP11416 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RaraP11416 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RaraP11416 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RaraP11416 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RaraP11416 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RaraP11416 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RaraP11416 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RaraP11416 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaraP11416 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaraP11416 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaraP11416 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaraP11416 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaraP11416 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaraP11416 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaraP11416 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RaraP11416 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RaraP11416 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RaraP11416 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RaraP11416 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RaraP11416 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RaraP11416 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RaraP11416 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RaraP11416 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RaraP11416 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RaraP11416 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RaraP11416 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RaraP11416 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RaraP11416 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RaraP11416 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RaraP11416 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RaraP11416 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RaraP11416 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.3 ms