Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top3aO70157 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top3aO70157 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3aO70157 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3aO70157 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3aO70157 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top3aO70157 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top3aO70157 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top3aO70157 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3aO70157 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top3aO70157 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3aO70157 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3aO70157 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3aO70157 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top3aO70157 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3aO70157 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top3aO70157 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms