Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx1aO35526 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx1aO35526 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stx1aO35526 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx1aO35526 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms