Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzd8B9EJ80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdzd8B9EJ80 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdzd8B9EJ80 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdzd8B9EJ80 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms