Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc173A0JLY1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc173A0JLY1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc173A0JLY1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc173A0JLY1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc173A0JLY1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms