Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930469K13RikA0A286YDB2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930469K13RikA0A286YDB2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms