Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUM8

Gm45140, Predicted gene 45140, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45140A0A0N4SUM8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Gm45140A0A0N4SUM8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24,95■■□□□ 1,59
Gm45140A0A0N4SUM8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Gm45140A0A0N4SUM8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Gm45140A0A0N4SUM8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gm45140A0A0N4SUM8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Gm45140A0A0N4SUM8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Gm45140A0A0N4SUM8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
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