Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSG3

Gm28269, MCG1047152, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28269A0A087WSG3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16,04■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,03■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16,02■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Gm28269A0A087WSG3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,99■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,99■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,97■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15,97■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,97■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,96■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15,96■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15,96■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,96■□□□□ 0,15
Gm28269A0A087WSG3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,92■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15,91■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15,91■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,91■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,9■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15,9■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Gm28269A0A087WSG3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,89■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15,88■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,88■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms