RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635231.1

QARS-238, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-238	ENST00000635231	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		10.04	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		10.04	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		10.04	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	CENPE	Q02224	2701 aa		10.04	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	ITPR2	Q14571	2701 aa		10.04	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	CCDC78	A2IDD5	438 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	ISM1	B1AKI9	464 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	AP2A1	O95782	977 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	ALB	P02768	609 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	UMOD	P07911	640 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	RBP3	P10745	1247 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	ALAS2	P22557	587 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	MMP11	P24347	488 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	TNFRSF8	P28908	595 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	CETN2	P41208	172 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	DBN1	Q16643	649 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	SYTL3	Q4VX76	610 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	STYX	Q8WUJ0	223 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	INPP5D	Q92835	1189 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	FKBP10	Q96AY3	582 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	AGAP4	Q96P64	663 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	CDC23	Q9UJX2	597 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
QARS-238	ENST00000635231		A0A1B0GX78	115 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	PJA2	O43164	708 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	HCRTR1	O43613	425 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	OR56A5	P0C7T3	313 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	EDN3	P14138	238 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	ACADL	P28330	430 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	CDC16	Q13042	620 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	SPARCL1	Q14515	664 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	BRD3	Q15059	726 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	PACS1	Q6VY07	963 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	KCNMB4	Q86W47	210 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	KRT35	Q92764	455 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	TTC1	Q99614	292 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	RUBCNL	Q9H714	662 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	WDR54	Q9H977	334 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	EURL	Q9NYK6	297 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		10.02	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	MASP2	O00187	686 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	PSMD3	O43242	534 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	LRRTM2	O43300	516 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	TJP3	O95049	919 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	ONECUT2	O95948	504 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	RPN2	P04844	631 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	PRSS56	P0CW18	603 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	ITGAX	P20702	1163 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	PTPN7	P35236	360 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	RAB28	P51157	221 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	GRM7	Q14831	915 aa		10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
QARS-238	ENST00000635231	TLR1	Q15399	786 aa		10.01	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms