RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	FBXO10	Q9UK96	956 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1W2PQ67	120 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362		A8MT66	165 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362		L7N2F9	121 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	HOXA2	O43364	376 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	ELK4	P28324	431 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PIGF	Q07326	219 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	EPGN	Q6UW88	154 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	LPP	Q93052	612 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	TBX5	Q99593	518 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362		A6NHS1	94 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CD72	P21854	359 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PDHA2	P29803	388 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	ACSL1	P33121	698 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	BIRC7	Q96CA5	298 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	OR2AT4	A6NND4	320 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC7A4	O43246	635 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	TBL1X	O60907	577 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CDRT1	O95170	752 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	APOL3	O95236	402 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	IMPDH1	P20839	514 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	ADORA2A	P29274	412 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	BRCC3	P46736	316 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	ITIH5	Q86UX2	942 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC9A6	Q92581	669 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	ISM1	B1AKI9	464 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	GLDC	P23378	1020 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	GMIP	Q9P107	970 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SEPT4	O43236	478 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CFH	P08603	1231 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	GNAO1	P09471	354 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	BEND5	Q7L4P6	421 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PARG	Q86W56	976 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	C17orf64	Q86WR6	236 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM2	Q9C040	744 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PHF24	Q9UPV7	400 aa		11.49	□□□□□ -0.57
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		11.49	□□□□□ -0.57

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